مدل سازی مشترک تغییرات هیستون در شکل ژنوم سه بعدی از طریق نمودار تعامل Hi-C
| عنوان | مدل سازی مشترک تغییرات هیستون در شکل ژنوم سه بعدی از طریق نمودار تعامل Hi-C |
|---|---|
| نویسنده | سفر، امره |
| تاریخ انتشار: | 2021 |
| محل انتشار | - اسپرینگر |
| موضوع | الگوریتم ها، بیوانفورماتیک، اپی ژنتیک، Hi-C، پوشش مجموعه |
| نوع | سند |
| زبان | انگلیسی |
| دیجیتال | بله |
| نسخه خطی | خیر |
| کتابخانه: | دانشگاه اوزیغین |
| شناسه دارایی کتابخانه | 978-303065350-7 |
| شماره ثبت | 053d5739-acf3-454a-befb-a9bc652ccc6c |
| محل کتابخانه | علوم کامپیوتر |
| تاریخ | 2021 |
| متن نمونه | آزمایشهای جذب ترکیب کروموزوم مانند Hi-C برای نقشهبرداری از سازمان فضایی سهبعدی ژنومها استفاده میشود. حتی اگر فعل و انفعالات Hi-C نسبت به هیچ یک از اصلاحات هیستون تعصب نداشته باشند، تجزیه و تحلیل قبلی برهمکنش های متراکم تری را در اطراف بسیاری از تغییرات هیستون نشان داده است. با این وجود، اثرات همزمان این تغییرات در نمودار تعامل Hi-C هنوز به طور کامل مشخص نشده است و درک ما از شکل ژنوم را محدود می کند. در اینجا، پوشش Hi-C را برای تجزیه نمودار تعامل Hi-C از نظر تغییرات هیستون شناخته شده پیشنهاد می کنیم. پوشش Hi-C مبتنی بر مجموعه چند پوششی با جفت است، که در آن هر تعامل Hi-C توسط جفت های اصلاح هیستون پوشش داده می شود. ما 4 اصلاح هیستون H3K4me1، H3K4me3، H3K9me3، H3K27ac را به طور قابل توجهی پیش بینی کننده بیشتر تعاملات Hi-C در گونه ها و انواع سلول ها می دانیم. پوشش Hi-C در پیشبینی برهمکنشهای Hi-C و دامنههای مرتبط با توپولوژی (TADs) در یک گونه کاملاً مؤثر است، با توجه به اینکه روی گونهها یا انواع سلولی دیگر آموزش داده شده است. |
| DOI | 10.1007/978-3-030-65351-4_33 |
| Cilt | 944 |
