النمذجة المشتركة لتعديلات هيستون في شكل الجينوم ثلاثي الأبعاد من خلال الرسم البياني للتفاعل Hi-C
| العنوان | النمذجة المشتركة لتعديلات هيستون في شكل الجينوم ثلاثي الأبعاد من خلال الرسم البياني للتفاعل Hi-C |
|---|---|
| المؤلف | سيفر، إمري |
| تاريخ النشر: | 2021 |
| مكان النشر | - سبرينغر |
| الموضوع | الخوارزميات، المعلوماتية الحيوية، علم التخلق، Hi-C، مجموعة الغلاف |
| النوع | وثيقة |
| اللغة | الإنجليزية |
| رقمي | نعم |
| مخطوط | لا |
| المكتبة: | جامعة اوزيجين |
| معرف أصل المكتبة | 978-303065350-7 |
| رقم السجل | 053d5739-acf3-454a-befb-a9bc652ccc6c |
| موقع المكتبة | علوم الكمبيوتر |
| التاريخ | 2021 |
| نص عينة | تُستخدم تجارب التقاط تشكيل الكروموسوم مثل Hi-C لرسم خريطة التنظيم المكاني ثلاثي الأبعاد للجينومات. على الرغم من أن تفاعلات Hi-C ليست منحازة نحو أي من تعديلات هيستون، فقد كشف التحليل السابق عن تفاعلات أكثر كثافة حول العديد من تعديلات هيستون. ومع ذلك، فإن التأثيرات المتزامنة لهذه التعديلات في الرسم البياني للتفاعل Hi-C لم يتم تحديدها بالكامل بعد، مما يحد من فهمنا لشكل الجينوم. هنا، نقترح تغطية Hi-C لتحليل الرسم البياني للتفاعل Hi-C من حيث تعديلات هيستون المعروفة. تعتمد التغطية Hi-C على مجموعة متعددة الأغلفة مع أزواج، حيث يتم تغطية كل تفاعل Hi-C بواسطة أزواج تعديل هيستون. نجد أن 4 تعديلات هيستون H3K4me1، H3K4me3، H3K9me3، H3K27ac تنبئ بشكل كبير بمعظم تفاعلات Hi-C عبر الأنواع وأنواع الخلايا. تعد تغطية Hi-C فعالة جدًا في التنبؤ بتفاعلات Hi-C والمجالات المرتبطة طوبولوجيًا (TADs) في أحد الأنواع، نظرًا لأنه تم تدريبها على أنواع أو أنواع خلايا أخرى. |
| DOI | 10.1007/978-3-030-65351-4_33 |
| Cilt | 944 |
