برچسب گذاری متریک و تعبیه نیمه متریک برای پیش بینی حاشیه نویسی پروتئین

عنوان برچسب گذاری متریک و تعبیه نیمه متریک برای پیش بینی حاشیه نویسی پروتئین
نویسنده سیفر، امره، کینگزفورد، سی.
تاریخ انتشار: 2021-05-01
محل انتشار - مری آن لیبرت، شرکت
موضوع هستی شناسی ژن، برچسب گذاری متریک، پیش بینی عملکرد پروتئین
نوع دوره ای
زبان انگلیسی
دیجیتال بله
نسخه خطی خیر
کتابخانه: دانشگاه اوزیغین
شناسه دارایی کتابخانه 1066-5277, 1066-5277
شماره ثبت 5cb0f7ff-5992-4bfa-8d41-3b76567cb575
محل کتابخانه علوم کامپیوتر
تاریخ 2021-05-01
متن نمونه تکنیک‌های محاسباتی در پیش‌بینی عملکرد پروتئین از روی داده‌های رابطه‌ای (برهم‌کنش‌های عملکردی یا فیزیکی) موفق بوده‌اند. این تکنیک‌ها برای تولید فرضیه‌ها و جهت تأیید اعتبار تجربی استفاده شده‌اند. با چند استثنا، کار به عنوان مسائل طبقه‌بندی چند برچسبی مدل‌سازی می‌شود که در آن برچسب‌ها (توابع) به‌طور مستقل یا نیمه مستقل درمان می‌شوند. با این حال، پایگاه های داده ای مانند هستی شناسی ژن اطلاعاتی در مورد شباهت های بین توابع ارائه می دهند. ما استفاده از مسئله بهینه‌سازی ترکیبی برچسب‌گذاری متریک را برای استفاده از فواصل محاسبه‌شده اکتشافی بین توابع برای پیش‌بینی دقیق‌تر عملکرد پروتئین در شبکه‌های مشتق‌شده از هر دو تعامل فیزیکی و ترکیبی از انواع دیگر بررسی می‌کنیم. برای انجام این کار، ما یک تکنیک جدید (بر اساس بهینه سازی محدب) برای تبدیل فواصل نیمه متریک اکتشافی به متریک با حداقل اعوجاج حداقل مربعات (LSD) ارائه می دهیم. نشان داده شده است که رویکرد برچسب گذاری متریک از پنج تکنیک موجود برای استنتاج عملکرد از شبکه ها بهتر عمل می کند. این نتایج نشان می‌دهد که برچسب‌گذاری متریک برای پیش‌بینی عملکرد پروتئین مفید است و به حداقل رساندن LSD می‌تواند به حل مشکل تبدیل فواصل اکتشافی به متریک کمک کند.
DOI 10.1089/cmb.2020.0425
Cilt 28
مشاهده در منبع دانشگاه اوزیغین دانشگاه اوزیغین - موتور جستجوی آثار تاریخی، آرشیوها و نشریات
دانشگاه اوزیغین - موتور جستجوی آثار تاریخی، آرشیوها و نشریات دانشگاه اوزیغین

برچسب گذاری متریک و تعبیه نیمه متریک برای پیش بینی حاشیه نویسی پروتئین

نویسنده سیفر، امره، کینگزفورد، سی.
تاریخ انتشار 2021-05-01
محل انتشار - مری آن لیبرت، شرکت
موضوع هستی شناسی ژن، برچسب گذاری متریک، پیش بینی عملکرد پروتئین
نوع دوره ای
زبان انگلیسی
دیجیتال بله
نسخه خطی خیر
کتابخانه دانشگاه اوزیغین
شناسه دارایی کتابخانه 1066-5277, 1066-5277
شماره ثبت 5cb0f7ff-5992-4bfa-8d41-3b76567cb575
محل کتابخانه علوم کامپیوتر
تاریخ 2021-05-01
متن نمونه تکنیک‌های محاسباتی در پیش‌بینی عملکرد پروتئین از روی داده‌های رابطه‌ای (برهم‌کنش‌های عملکردی یا فیزیکی) موفق بوده‌اند. این تکنیک‌ها برای تولید فرضیه‌ها و جهت تأیید اعتبار تجربی استفاده شده‌اند. با چند استثنا، کار به عنوان مسائل طبقه‌بندی چند برچسبی مدل‌سازی می‌شود که در آن برچسب‌ها (توابع) به‌طور مستقل یا نیمه مستقل درمان می‌شوند. با این حال، پایگاه های داده ای مانند هستی شناسی ژن اطلاعاتی در مورد شباهت های بین توابع ارائه می دهند. ما استفاده از مسئله بهینه‌سازی ترکیبی برچسب‌گذاری متریک را برای استفاده از فواصل محاسبه‌شده اکتشافی بین توابع برای پیش‌بینی دقیق‌تر عملکرد پروتئین در شبکه‌های مشتق‌شده از هر دو تعامل فیزیکی و ترکیبی از انواع دیگر بررسی می‌کنیم. برای انجام این کار، ما یک تکنیک جدید (بر اساس بهینه سازی محدب) برای تبدیل فواصل نیمه متریک اکتشافی به متریک با حداقل اعوجاج حداقل مربعات (LSD) ارائه می دهیم. نشان داده شده است که رویکرد برچسب گذاری متریک از پنج تکنیک موجود برای استنتاج عملکرد از شبکه ها بهتر عمل می کند. این نتایج نشان می‌دهد که برچسب‌گذاری متریک برای پیش‌بینی عملکرد پروتئین مفید است و به حداقل رساندن LSD می‌تواند به حل مشکل تبدیل فواصل اکتشافی به متریک کمک کند.
DOI 10.1089/cmb.2020.0425
Cilt 28
دانشگاه اوزیغین - موتور جستجوی آثار تاریخی، آرشیوها و نشریات
دانشگاه اوزیغین شما در حال هدایت مجدد هستید...

لطفاً صبر کنید