إعادة البناء الأمثل لديناميكيات تطور الرسم البياني للنماذج القائمة على الازدواجية
| العنوان | إعادة البناء الأمثل لديناميكيات تطور الرسم البياني للنماذج القائمة على الازدواجية |
|---|---|
| المؤلف | جيلمور، س.، سيفر، إمري |
| تاريخ النشر: | 2024-02-29 |
| مكان النشر | - طبيعة سبرينغر |
| الموضوع | مؤشر أسعار المنتجين، إعادة بناء تاريخ الأجداد، طفرة الازدواجية مع طفرة عشوائية، DMR |
| النوع | وثيقة |
| اللغة | الإنجليزية |
| رقمي | نعم |
| مخطوط | لا |
| المكتبة: | جامعة اوزيجين |
| معرف أصل المكتبة | 1860-949X |
| رقم السجل | e5a6dd92-74ba-49c8-9de5-9c9f2425f06d |
| موقع المكتبة | علوم الكمبيوتر |
| التاريخ | 2024-02-29 |
| نص عينة | إن الأبحاث حول تطور الشبكة البيولوجية ونماذج نمو الرسم البياني، مثل نموذج الازدواجية مع الطفرة العشوائية (DMR)، تمكننا من وصف الديناميكيات التطورية لشبكة تفاعل البروتين المبنية على الازدواجية والتباعد عبر الطفرة بطريقة مبدئية. تركز الأساليب الحالية لإعادة بناء الرسوم البيانية للأسلاف التاريخية لنموذج DMR بشكل أساسي على الأساليب الجشعة وتؤدي إلى حلول دون المستوى الأمثل. في هذه الدراسة، توصلنا إلى ILP-DMR، وهي صياغة جديدة تعتمد على البرمجة الخطية الصحيحة (ILP)، لإعادة بناء الرسوم البيانية التاريخية لمؤشر أسعار المنتجين (PPI) من خلال تعظيم الاحتمالية عبر نموذج DMR. نقوم بتقييم فعالية نهجنا في إعادة بناء تاريخ التاريخ الاصطناعي والأمثل للبروتينات من عائلات عوامل النسخ bZIP. بالمقارنة مع التقنيات الحالية، فإن الحلول التي يتم إرجاعها بواسطة ILP-DMR لدينا لديها احتمالية أعلى وأكثر قوة في عدم تطابق النماذج والضوضاء في البيانات. تتمتع الحلول المستخرجة بواسطة ILP-DMR باحتمالية أعلى من الطرق الحالية، وتتفق حلولنا بشكل أفضل مع النتائج البيولوجية للدراسات المختلفة. تتوفر مجموعات البيانات والتعليمات البرمجية الخاصة بنا على https://github.com/seferlab/dmrhistory. |
| DOI | 10.1007/978-3-031-53499-7_38 |
| Cilt | 1142 |
